Que te reproduzca los MKV te lo veo difícil, tendrás que ver en la web oficial a ver si hay alguna actualización de firmware que lo solucione, pero dudo que exista, igual el chip no los soporta. Que no te lo deje almacenar ya me parece más raro. ¿Cómo estás probando?. Prueba de un stick USB al media center, conectándolo directamente por USB al PC, o por LAN si tiene. Yo creo que debería dejarte usarlo como almacenamiento, pero no lo sé, no tengo ese modelo.