Para ver MKV no hace falta colocar nada.
Para ver ciertas películas(no todas) VC1 o M2TS(Blu Ray original,para que entiendas) por su contenido necesitan tener instaladas ciertas aplicaciones,ya puedes instalarlas dentro o fuera del aparato,se recomienda dentro para no ocupar un USB externo,para eso han colocado el USB interno.
Cuando se conecte los dispositivos USB y automáticamente sea montado como PERSISTFS, no se tendrá acceso a esa memoria mediante el mando del C200,por eso recomiendan 2 o mas Gb para uso dedicado,yo he puesto 4Gb por que estaba al mismo precio que la de 2Gb
Lo de la instalación del lápiz USB y creación de directorios carpetas es muy,muy fácil,más arriba está detallado paso a paso.
Saludos