Como te han dicho, el tipo de cable debería dar igual (a no ser que alguno de ellos tenga un problema), ya que ambos usan el mismo standard de señales digitales

Lo que sí puede que te varíe es el conectar de la PS3 a la tv y de la tv al Home cinema, ya que algunas teles no sacan audio de la misma manera que lo reciben de una fuente externa, así que deberías investigar tu caso

Si quieres curarte en salud, saca el audio por óptico y punto. Entiendo que tu home cinema no tiene entrada HDMI, no?