Problema con disco duro externo y dvd con lector usb

Bueno pues como comento en el título tengo un problema con un disco duro externo y un dvd con lector usb, la verdad es que el problema es un poco raro.
El tema es el siguiente, tengo un disco duro externo de 500gb que tuve que formatear en fat32 para que el dvd me lo admitiera y hasta ahí ningún problema le cargo las pelis y las veo perfectamente, pero de vez en cuando hay alguna que no la veo, al principio pensé que era problema del formato en el que se encontraba la película, pero un día probé metiendo esas películas que no se reproducen desde el disco duro en un pen drive y cual fue mi sorpresa que si se veían desde el pen drive sin cambiar formato ni nada, pero no hay manera desde el disco duro externo.
¿Por qué puede ser que ocurra esto?
¿Cómo podría solucionarlo? es que es una pesadez tener que andar cambiando de un dispositivo a otro sólo para algunas pelis.
Gracias por adelantado