¡QUE CAÑA!
Primero felicitarte por lo que has conseguido, no por el montaje, que tiene su mérito pero menor, si no por ser capaz de reconocer que no suena como debe y que debes investigar para mejorarlo.

NO soy un experto en construcción de altavoces, cuestiona todo aquello que te cuente, investiga y saca tus propias conclusiones.

Bien por el tweeter, en un recinto aparte.
tenias que haber hecho lo mismo con los dos drivers, aún que en menor medida, cuando la membrana del más grande viaja hacia atrás, la del más pequeño hará de tubo bases reflex y tenderá a ir hacia delante.
Él woofer está bien separado, pero el sonido no es un ratoncillo, ese laberinto tiene que estar calculado en función de la frecuencia, no vale con poner obstáculos, ante la duda yo lo quitaría.
Biamplificar:
Un woofer con el tamaño que se aprecia necesitará casi con toda certeza una etapa aparte, podrías prescindir de ella, si al final no esperas usarlo con gran volumen, si no para dentro de una habitación de tamaño estándar.
La adaptación de impedancia a de cada elemento, junto con el filtro es importante para no quemar el receptor o las etapas.
Los filtros han de estar calculados para las frecuencias de corte de cada tweeter, driver, woofer, la calidad depende de eso, no de la calidad de los componentes.
Un proyecto así necesitará ecualizacion si o si, si usas un PC como fuente, mínimo un foobar2000+mathaudio+micro calibrado.(quizás sirve el del YPAO)
La ecualizacion del YPAO del Yamaha es posible que no sea suficiente ya que no tendrá puntos de ajustes suficientes, aunque seguro que mejora.
Esa calibración/ecualizacion atenuará las frecuencias medias tan presentes.

Divide y vencerás, intenta en primera instancia, obtener buen sonido después de la calibración con él tweeter y el driver grande, yo desmontaría el driver pequeño.
El corcho no lo veo, guata, copopren, podría ayudar,