Estás trabajando con mucha resolución. Ponlo a 1/6. Para el subwoofer sí podrías trabajar a esa resolución. Yo veo en la segunda gráfica que sólo corriges de 100hz hacia abajo. Por lo que deduzco que sólo has ecualizado el subwoofer. Con el fbq1000 sólo puedes ecuarlizar dos canales. Al otro canal que te queda libre, qué le tienes conectado?

A ver si puedes aportar más datos.