Si no me equivoco no hay problema de que tu placa tenga 2.0 y la grafica 3.0.Tengo un amigo que tiene una grafica 2.0 en una placa con puerto 1.0 y le funciona perfecta.
Acabo de buscar en internet informacion y parece que no hay problema.De todos modos pregunta si quieres a alguien mas entendido