Yo mismo tengo un sistema 2.1 con dos monitores y un subwoofer.como mi ampli no tiene salida especifica para sub lo tengo conectado del segundo modo que te comentaba antes.de esta manera
el ampli manda la señal completa al sub ,este se queda y reproduce las frecuencias que tu le asignes
con la rosca del corte de frecuencia y envia las demas frecuencias a los monitores.
No deberia preocuparte un exceso de graves en los monitores ya que de este modo no se duplica la reproduccion de frecuencias ,simplemente se reparten entre cajas y sub.
Yo en tu caso aun teniendo sub buscaria unos monitores siguiendo el mismo criterio que seguiria si no tubiera sub, cuanto mas completa sea la gama de frecuencias que reproduzcan de una manera eficiente mejor.
Te comento esto porque un sub principalmente te va a extender la gama de frecuencias hacia abajo
y lo ideal seria ajustarlo al punto en que los monitores empiecen a atenuar demasiado su respuesta de frecuencia,si un altavoz da poco grave(baja poco) tendras que subir demasiado este punto de corte lo
cual para mi gusto no es lo mas deseable,prefiero cortar mas bien bajo,no mas de 70-75hz.
En resumen,que dentro de tu presupuesto busques la caja mas completa posible y despues ajustes tu sub a las cajas y no al reves(las cajas al sub).
Espero no haberte liado con el tocho que te he soltado,un saludo.