La existencia o no del subwoofer se la tienes que poner en la configuración, efectivamente. Tendrás que tocar para empezar:

- Tamaño de los altavoces (para empezar "small")
- Distancia al punto de escucha (o retardos) de cada altavoz.
- Subwoofer y frecuencia de corte (por debajo de la cual todo va al sub, para empezar pon 80 Hz)
- Volumen de cada altavoz
- Control de graves y agudos.

Luego tendrás mil historias más, pero de momento te valdrá. Mírate el manual del ampli que suele venir relativamente claro.

Efectivamente, el sub también funciona cuando escuchas música, aunque a mí no me suele gustar el sonido. Tendrás que jugar con ello y ver como responden tus frontales sin o con subwoofer.

Un saludo