Lo hicieron para cobrarte un doble RCA en vez de uno solo, que te hubiera salido más barato... las tiendas son así de listas.
No ocurre nada, ya que en caso necesario, la calibración del AVR te re-ajustará los niveles de salida del sub. Pero hubo una temporada que instalar los subs de esa manera era "trending topic" en el foro... Ahora ese tipo de conexión por lo visto ya ha caído en desgracia (como no podía ser de otra manera).
A malas siempre puedes usar solo uno de los RCAs, rojo en el AVR y rojo en el subwoofer, por ejemplo. Y dejar el otro desconectado.
Un saludo del Oso