Normalmente se ponen en una esquina y frente al punto de escucha para reforzar la frecuencias reproducidas y que éstas sean lo más claras posibles.

Los graves tienen una longitud de onda muy larga - varios metros - y salvo excepciones nunca podemos oir correctamente el sonido. Rebota en la pared trasera a la mitad de la onda con un poco de suerte.

Contra más distancia haya hasta la pared posterior, mejor.

Un error posible suele ser ponerlo en el centro de la sala.
El sonido rebota en tantas paredes que te da un pasmo con tanta cancelación y refuerzo de frecuencias.

En más de una página he leido que una forma de saber cual es la mejor posición del subwoofer, es ponerlo donde te sentarías, reproducir cualquier cosa que haga sonar el sub y moverte por la sala.

Donde mejor se oigan los graves, ahí va el rompecopas.

Lo importante es probar y probar.

Un saludo.