Yo hago una EQ para el sub y otra EQ para cada caja independiente. Después mido la respuesta conjunta (probando varios slopes y cortes para todos igual) y retoco por un lado la parte del sub (aquí muy leve porque también afecta al canal LFE) y por otro lado retoco cada caja independiente y después voy comprobando la respuesta conjunta de cada canal + sub. Si hay que sacrificar algo lo hago en los los canales surround.