Otra opción es que en la BIOS indiques que el sistema operativo es 'Plug and play' y sea éste el que se encargue de detectar cambios.

En algunas placas indican un cierto riesgo de reinstalación del SO al reiniciar el ordenador.

W2000. Intenta recordar si activaste alguna directiva de seguridad que pudiera desactivar el acceso o el reconocimiento de los lectores.
En el trabajo tenemos 90 PC con la disquetera desactivada de ese modo.

Un saludo.