Bajo mi punto de vista si estas convencido de que siempre vas a tener un único punto de utilización, puede ser interesante tener un HTPC con muchos discos, pero en cuanto vayas a usar mas puntos, yo tengo claro que es mejor tener un NAS centralizado, ventajas:

a) Menor consumo para tenerlo encendido todo el rato (funcion Wake-on lan o programadas)
b) Menor ruido del HTPC: si no necesitas almacenamiento en el ordenador que uses para reproducir, con un SSD pequeño te vale, y puedes hacer un PC sin ventiladores practicamente
c) Poder utilizar reproductores de red mas baratos en cualquier punto de la casa
d) Posibilidad de poder utilizar bibliotecas compartida
e) Configuraciones en Raid que te protegen los datos