Dudas y consejos HTPC

Hola trompesoft.
- Con un HTPC puedes ver lo que quieras, es decir, no existe limitación a diferencia de otros reproductores blu-ray o mediacenters.
Al ser un sistema abierto, puedes ir actualizándolo tú sin tener que esperar firmwares y demás historias.
- El sonido depende de la tarjeta de sonido, pero si tu intención es usar un amplificador para que éste gestione los diferentes formatos, bastará con indicar en la configuración de sonido de windows/tarjeta de sonido integrada, que quieres sacar el sonido por HDMI y éste saldrá a través de la gráfica hacia el ampli sin ningún problema.
- Programas hay muchos y para todos los gustos. Lo ideal es que uses un reproductor que te permita configurarlo a tu gusto a través de codecs tanto internos como externos hasta encontrar la mejor combinación. Está el Zoom Player, MPC, KMPlayer.... Hay muchos.
También deberás de tener a mano algún reproductor del tipo PowerDVD, TotalMedia Theatre, WinDVD... que te vendrá muy bien para reproducir blu-ray's y contenido 3D.
Lo ideal es probar varios y quedarte con el que más te guste.

En relación a la configuración que has puesto, te puede servir perfectamente. No tendrás ningún problema.
La verdad es que este foro en concreto (HTPC) de forodvd está muy parado, por lo que lo mejor es que accedas a otros sitios más activos de la red, aunque supongo que ya lo habrás hecho.
En relación a la caja, lo ideal será comprar una caja de sobremesa propiamente dicha, es decir, aquella caja de posición horizontal destinada a colocar en un mueble tipo televisor... (no sé si me explico). Las hay de todos los precios. Desde las Nox, ThermalTake o las Antec (cajas económicas) hasta las Lian-li o Silverstone (cajas con más florituras como pequeñas pantallas en su frontal... etc., destinadas para usuarios más sivaritas). Hay cientos de modelos y precios.

Saludos.