He visto el título y no he podido dejar de entrar.

He leído por encima... de disco duro yo elegiría un SSD, hoy por hoy ya puedes encontrar baratos alguno de incluso 40gb. La diferencia de velocidad y soltura de funcionamiento se nota y mucho.

En segundo lugar un htpc (por experiencia propia y ajena) no se ha de usar para todo lo demás que no sea reproducción de video, ya que se desconfigura con una facilidad pasmosa con ese traqueteo. Lo que propongo es una arranque doble uno para "todo camino" y otro dedicado sólo a htpc. El ssd se lo pones a la parte que te guste más y listos.

El arranque doble es muy fácil de hacer. Una vez tienes instalado un sistema operativo, con el encendido y funcionando instalas otro en una partición distinta. Windows ya se encarga de instalar el arranque.