Hay varios modelos; atmolight, boblight, etc.
Efectivamente, el sistema que utilizo es por zonas. Las zonas las haces a tu gusto, si tienes en un lateral 14, 20 o 50 leds, esas serán las zonas independientes que tendras, nada de hacer una media de todo el lateral.
De todas formas te has adelantado por que en la ultima parte del manual iba a explicar este proceso. Ya veras que todo quedara muy claro.

Saludos.