El MBR (Master Boot Record) tiene una limitación de direccionamiento de 2 teras, con lo que podrías particionar el disco en MBR, pero con dos particiones.

Lo mejor es usar GPT (GUID Partition Table), que no tiene esa limitación de 2 teras, y con sistemas Windows 7 funciona estupendamente siempre que no lo uses como disco de arranque (que necesitas una BIOS UEFI y ciertos requerimientos).

Desde el administrador de discos de Windows, estando el disco completamente vacío y sin particiones, al inicializarlo te saldrá esto:



Si no te sale por lo que sea, puedes borrar el disco duro totalmente con diskpart, pero ten mucho cuidado si haces esto, no vaya a ser que borres el disco que no es xD

-Ve a inicio --> Ejecutar --> y escribes "diskpart"
-En la shell que te sale escribes "list disk" y ves que disco es el que quieres formatear (el de tres teras).
-Ahora escribes "select disk n", siendo n el número que tenía el disco duro al hacer el "list disk"
-ahora introduce el comando "clean".

Con esto el disco se queda totalmente vacío, y ahora desde el administrador de discos te debe dejar inicializarlo como GPT y crear una partición NTFS de tres teras en él.

Un saludo