Actualizo por si alguien puede dar con la solución.
Si pongo un pendrive directamente a la TV con una película que tenga audio DTS, el amplificador (siempre vía HDMI ARC) lo decodifica perfectamente.
Por tanto, está claro que es un problema de Plex, a ver si a alguno os pasa lo mismo y lo podemos solucionar, o simplemente en alguna actualización de la APP Plex se termine solucionando.
Gracias.