Vamos a ver, es que es POR LA MEZCLA. Me estás comparando DOS MEZCLAS diferentes. Compara LA MISMA MEZCLA, pero los dos formatos, al mismo nivel de volumen.

Los canales tienen la información sonora que tienen, sean en AC3 o wn WAV, basta abrirlos con un editor de sonido y ver la forma de onda.

No es tema de compresión. La compresión no "quita sonidos", sino que limita la calidad de éstos.

Aquí la clave está en LA MEZCLA.