En cuanto a calidad de video es exactamente igual un remux que el full BD, el video es el mismo, misma tasa de bits y toda la parafernalia. Echadle un vistazo con el mediainfo y lo vereis. Lo unico que cambia es el contenedor, pero el codec es el mismo tambien.
Yo al proyector solo le doy de comer Bdremux o fulls, en una pantalla de 160" cuanta menos compresion mejor.

Saludos.