Mi consejo es que pruebes y decidas ponelo como a ti te suene mejor. Parece que los 80 Hz. son un estándard pero no es un dogma, no es una doctrina siempre a seguir.
Si el Audyssey te lo deja en esa configuración es seguramente porque detecta que tus nuevos altavoces tienen más posibilidades de reproducir bajas frecuencias, y que junto con el sub que tienes el sistema se desenvuelve a la perfección. Puedes probar también si así lo deseas a ponerlo todo en LARGE, o al menos los frontales y ves qué tal.
Insisto, lo mejor siempre es lo que mejor te suene a ti, y no hay que dejarse incluenciar siempre por configuraciones tipo.
Saludos!