El problema con las multi-cajas es que cada una emite su propio grave, que será distinto al canal colindante. Los modos problemáticos se ha de trabajar tratando los graves como "un todo" aunque sea con varios subs.
Para que este principio fuese efectivo no deberías contar con ningún subwoofer, ya que esta sería la única forma de enviar el canal LFE a todos los altavoces por igual. A la que pones un solo sub, el canal LFE se envía a él y el resto de altavoces aún configurados en "grande" , solo reproducirán sus propias frecuencias graves, que como he dicho antes serán distintas para cada altavoz.

Por otra parte, el trabajar sin subwoofer penaliza mucho al receptor, esos 500, 800 y hasta 1500w de potencia que tienen los subs distan mucho de poder ser entregados con un mínimo de garbo por un receptor a -pongamos- cinco altavoces de columna, por lo que si no cuentas con un AVR de alta gama (y aún pondría pegas) y quieres prescindir de subwoofer, te verás abocado a escuchar distorsión y (muchos) apuros si hablamos de un receptor normalillo...

Un saludo del Oso