Solucionado.

Efectivamente era el cable como habíais comentado. Después de mirar en las tiendas más cercanas a mi casa (Fnac, media markt) vi que los cables RCA eran idénticos en grosor/acabado al RCA que venía con el subwoofer, así que no quise arriesgarme a comprar otro que me diese el mismo problema. Pero ayer revisando los cables que tenía por casa, localizé un RCA de video, con mejor pinta, y ha sido cambiarlo y se ha ido el ruido. Ahora solo es perceptible minimamente si estas pegado al subwoofer y poniendo el ultrabass y la la ruleta de volumen al maximo.