Prince, iTunes de forma nativa no soporta FLAC. Supongo que con algún complemento de terceros se podría reproducir. De todos modos, como te decía antes, los 4 formatos no dejan de ser contenedores de formatos sin pérdidas. Partiendo de una grabación digitalizada con una profundidad de bits determinada y una frecuencia de muestreo determinada, no deberías poder distinguir entre ellas.

Los formatos WAV y AIFF no comprimen la información por lo que los tamaños de estos ficheros deberían ser iguales o superiores a los tamaños de los equivalentes FLAC y ALAC. El formato AIFF te permite incluir metainformación en el propio fichero, WAV no, o al menos solo la permite muy básica.

Cuando se habla de compresión en los formatos FLAC y ALAC, se refiere a la compresión del fichero, no de la información contenida. El formato de audio sigue siendo sin pérdidas.