Hola, como bien apuntas en tu primer mensaje, el principal problema que tienes es la sala, acústica, situación de altavoces y punto de escucha, acondicionamiento.

Sobre todo por los graves que indicas tan desconotrolados, no es otra cosa que la interacción con la sala (modos de la sala, y sobrepresión a partir de la resonancia baja cuanto más se baja en frecuencia). Aquí no hay otro modo de solucionar que, primero, partiendo de la posición menos mala de cajas y punto de escucha para sobre excitar esos modos lo menos posible (teóricamente lo calculas con algún soft tipo REW, luego en la práctica medir para corroborar), y posteriormente o complementario, si puedes ecualizar el extremo bajo (generalmente de 200 Hz hacia abajo, donde está la interacción con la sala, frecuencias estacionarias).

Ojo, unas mejores cajas te sonarán mejor (timbre, dispersión, respuesta en frecuencia), pero si no cuidas lo anterior, el problema de interacción con la sala permanecerá.

Respecto a la conexión óptica, no dudo que pueda estar mal, aun así, es habitual que esta conexión quede floja y pueda fallar, lleva una pequeña muesca casi imperceptible que al conectar has de empujar bien a fondo hasta que notes el "click" que encaja la misma, ¿has comprobado que no se trate de un simple fallo en esa conexión? Por salir de dudas.

Saludos.