Pues te ha dejado el nivel del sub al mínimo, tienes que bajarlo del potenciómetro del mismo sub y pasar la calibración de nuevo. Te lo debería dejar entre -5 y +5 aprox. en términos generales. Si te lo deja por ejemplo en -8, puede pasar, pero nunca en -12 o en +12, ya que indica que está fuera de limite, o por encima o por debajo (en tu caso concreto es que esta demasiado alto y Audissey no puede bajarlo mas) y el potenciómetro de Low Pass, ponlo al máximo, que seria 250Hz imagino. Ya el AVR te lo cortara donde debe (120Hz por lo normal)
Los cortes ponlos todos a 80Hz