Me doy yo mismo la solución (encontrada en avforums) por si le puede valer a alguien en un futuro.

El problema es que las especificaciones del HDMI 1.3 (en mi caso) no soportan un canal de vuelta de audio, cosa que el 1.4 sí, ya que va en otro par de cable. Por lo que para sacar el sonido de la TV a través del Onkyo es necesario una conexión de salida de audio de la TV y otra de entrada en el receptor, a mayores del HDMI. En mi caso utilizaré la óptica