Empezando por el final, da igual a qué entrada conectes el óptico procedente del TV.

Por lo que cuentas, creo que tienes el DVD conectado al TV (¿por euroconector?) y este al AVR por óptico.

Si es así, es normal que siempre se encienda el Dolby Prologic II, dado que la señal que envía el TV por esa salida solo es PCM estéreo, aunque le envíes señal 5.1 (Dolby o DTS) al televisor desde el DVD. Solo saldrá multicanal si procede de un canal TDT que emita en ese formato.

El Dolby Prologic transforma la señal estéreo en multicanal, pero no es lo mismo que la original. Si quieres oir la original, tienes que conectar directamente el DVD al AVR, por su salida de audio coaxial u óptica.