Como al final la solución me vino en otro hilo (gracias de nuevo Rologa), aquí en concreto https://www.forodvd.com/tema/90497-d.../index172.html explico como se solucionó por sí le resulta útil a alguien.

El problema de la red, se solucionó al cambiar el nombre en SMB de uno de los Dune, ya que por defecto tienen el mismo. Eso generaba los conflictos al configurar Yadis ya que uno "chafaba" al otro. En cuanto se cambió el nombre la red detectaba ambos sin mayor problema.

En cuanto a configurar Yadis en los dos Dune, al final opté por usar Yadis en uno y Zappiti en otro. Solución salomónica para evitar conflictos jejeje.

Gracias a todos por la ayuda. Un saludo.