No puedes quitar el altavoce central del 5.1 y conectarlo a ese ampli, primero porque pierdes el estereo, el central es un solo altavoz, y segundo porque dejas al home cinema sin uno de sus principales altavoces.
Tendrias que configurarlo en estereo.
¿vas a andar conectando y desconectando el altavoz central del ampli cada vez que uses el pc2?

Creo que te saldria mejor dejar los altavoces como están en el home cinema y pillarte una mesa de mezclas sencilla de 2 canales y conectar los 2 pc´s por analógico a la mesa y esta al ampli, podrias controlar el volumen de cada pc con la propia mesa.

Algo como esto, por ejemplo:
http://cgi.ebay.es/mesa-de-mezclas-f...item45fb80c52c