El cable es correcto. Las conexiones también.
A ver, el sonido del subwoofer durante el calibrado suele ser bastante bajo, lo suficiente para que lo detecte el micro, pero algunos oidos no lo escuchan. Dices que tienes las ruedas del sub a la mitad, lo cual lo veo correcto para el volumen, pero la rueda del crossover ponla al mínimo (50hz) para que la calibración recoja toda la gama de frecuencias. Te sugiero también que pongas el interruptor de encendido en ON ya que en Auto a veces no reacciona al calibrado (una vez calibrado lo puedes poner en Auto). Si con todo esto sigue sin funcionar (ojo, que no oirlo no quiere decir que no funcione) intenta subiendo un poco más el volumen probando tanto en la rueda del propio sub como en el canal del Onkyo.
Si aún así sigue sin funcionar puedes hacer la prueba de la pila, a ver si le llega corriente.
Saludos