Pues en algunos casos ocurre que si el audissey lo deja muy bajo, la señal que envía el avr no es suficiente para "excitar" al subwoofer y que empiece a funcionar.
En cualquier caso lo que debes hacer es bajar el pote del subwoofer y volver a calibrar. Estará correctamente calibrado cuando hayas bajado lo suficiente el potenciómetro para que la calibración lo deje mas o menos entre 0 y -5 db.