A mi ya me ha pasado dos veces lo mismo con el smart hub, que me han desaparecido dos veces las aplicaciones. Supongo entonces que es un fallo generalizado y que pronto lo solucionaran. Escribiré al SAT de samsung.
En cuanto a reproducir mkv a través de DLNA, sí que se puede. Instyalando plex media server en el ordenador (programa gratuito), reproduzco sin problemas mkv de hasta 20 gigas (no he probado de mayor tamaño)