Hola baphmet,
Creo que es imposible comparar ambos procesadores porque son arquitecturas diferentes, consumos diferentes, sistemas operativos diferentes....
Aun así, si el Athlon 64 es un monocore, creo que está claro que sería mejor el ARM A9, no ya quizás por potencia bruta, que no se si será mejor o no, pero sí por la optimización que tendrías con él.
Saludos