si el audio LPCM está en estéreo ¿para qué lo quieres en AC3? De donde no hay no se puede sacar. Hay un programa que utilizan para convertir una fuente estéreo en dolby sorround o dolby digital, 6 canales AC3 pero no te lo recomiendo. Simplemente busca las frecuencias más parecidas a la voz y las mete en el canal central pero con mucho eco. El resto en un guirigai. No recuerdo el nombre. Vi unos resultados por ahí de pena, conseguí el programa y después de una hora de pruebas vi que aquello era horrible.
Si estás hablando de un archivo .avi, no lo dices, pásalo a mp3. Tan simple como eso. Porque efectivamente el PCM ocupa muchísimo.