Hola de nuevo Evaso,

El tema de los discos duros es que hasta ahora se solían formatear usando MBR (Master boot record), pero éste tipo de formato está limitado a 2 terabytes. Aun así, puedes usar MBR con discos de más de dos teras, pero el tema es que tendrás un "corte" obligatorio a los dos teras, quedando como si fuera un disco duro de 2 teras y otro por el resto del espacio.

Pero es que si instalas Windows 7 (no se si pasa también con Windows 8, aún no he probado, no se si soporta GPT) en un disco de 3 teras, aunque podrás formatearlo usando MBR, el espacio a partir de los 2 teras quedará inutilizable. Se que hay una forma de hacerlo, pero no es la estándard, y es algo complicado.

Por supuesto, usando GPT (GUID Partition Table) en lugar de MBR se pueden tener sin problemas particiones de 3 teras y de mucho más, pero la cuestión es que Windows 7 no puede ser instalado en un disco que está formateado con GPT.

Puedes tener el Windows instalado en el SSD, y tener cuantos discos de 3 teras quieras formateados con GPT y particiones de 3 teras, el problema viene si quieres instalar Windows en uno de esos discos.

Un saludo