Que procesador y ram tienes...??

El video lo tendrás en *.avi ya editado (en Time line donde dices que va bien).

Primero prueba a pasar el video a: crear video - crear MPEG - configuración - Calidad DVD compatible
Una vez esté pasado, llevate ese video MPEG al timeline y comprueba audio. Después, crear video - crear disco - Configuración - Calidad video- Automático y La compresión de audio no la toques.

Si me das más pistas de equipo que tienes te podré ayudar más..
Y si el audio que se te desfasa es música o el audio ambiente del video..??

Saludos