Tras tres dias de duras investigaciones he conseguido que vaya perfecto, ponga mi solución por si a alguien le sirve:
Todo se trataba de la sincronizacion vertical.
Con tarjetas nvidia , nos vamos al panel de control -> controlar la configuracion 3D -> configuracion de programa y forzamos al stereoscopic player a sincronizacion vertical activada.
Funciona perfecto ahora , que gozada , suerte a los de los "parpadeos y vibraciones"
igualmente ya me he quedado con las ganas de verlo a 1280 , nadie puede subir el controlador?? porfavore