Yo tengo el mismo que tu y la situación del sub es la misma.
Lo que hice fue poner el sub en 180° y luego pasar el audyssey. Creó que al programa le da igual como este el sub, el te mide la respuesta que da y te lo regula.
Lo de la distancia que sea mayor es normal, es por algo de los retardos creó haber leído por ahí.
Y a la configuración su se la puede poner contraseña, hay una opción que pone bloquear configuración para que nadie toque.