No sé muy bien a lo que te refieres del micro pero si lo colocas como debe ser, calibra bien. Si tenias un V685, esta parte de calibración es nueva para tí. Lo de la copia manual y tocarla no sé si lo probaste con el V685.
Lo interesante con respecto a los graves y por ende a los subwoofers es que tienes el modo de bajas frecuencias. Piensa que con el sistema YPAO te deja a 31,5 Hzs los subwoofers y con el modo de bajas frecuencias te lo puede dejar a 16 Hzs si tu SVS llega. Yo tengo 2 SVS SB 2000pro y antes tenía uno sólo y con la EQ que me da este modo, pasado al modo plano o natural gana muchísimo los bajos.
Y sí, subir los diálogos no es lo mismo que el central, pero tampoco es normal ir cambiando los niveles de los altavoces cada dos por tres, que ya te ha calculado el YPAO.