yamaha a-s1000

A ver si te he entendido bien..

Utilizas el sony porque la señal del plato con el yamaha es baja (no así la del cd).
Y, aprovechando que ya tienes los jbl conectados al sony, amplificas los frontales con él y el resto de canales con el yamaha cuando escuchas multicanal. Es así?

Convendría saber que plato tienes, pero EMHO lo lógico sería conectar todo al yamaha (cd y plato) y usar también el yamaha para los frontales tanto en estéreo como en multicanal, y más si te gusta el sonido del yamaha.
El único problema sería el bajo nivel de salida del plato.
Puede que el problema esté en que la entrada de phono del yamaha está preparada para giradiscos con cápsula MM y tu plato tenga cápsula MC, de ahí su bajo nivel de salida.
No soy un gran entendido en platos, lo mío son los unos y ceros pero creo que existen transformadores, te lo miraré. Sería la solución más barata y te ahorras trastos, otra opción sería cambiar a un plato con cápsula MM o salida de linea.