Lo habitual suele ser configurar los frontales como SMALL (aunque sean columnas) y cortarlos a 80Hz, ya que el sub, al tener más libertad en su ubicación, suele ser posible conseguir con él una respuesta en graves más lineal que con las columnas.

Pero si la ubicación del sub no la puedes modificar, pues simplemente haz pruebas, y quédate con la opción que más te guste.

Aunque por otra parte, si dejas los altavoces en LARGE, las frecuencias del canal LFE las reproducen a la vez los frontales y el sub, así que podría haber problemas de cancelaciones de frecuencias entre ellos.

Respecto a poner LFE a 120Hz o a 80Hz, suele recomendarse 120Hz porque en ese canal puede haber grabadas frecuencias hasta esos 120Hz. El problema es que por encima de los 80Hz los graves pueden empezar a ser "localizados", es decir, podría parecerte que los graves salen de la esquina del salón donde tienes el subwoofer.

Si pones el LFE a 80Hz realmente tampoco perderías totalmente los sonidos de 80-120Hz, ya que el canal LFE suele estar duplicado en el resto de canales, pero eso sí, el canal LFE presenta una ganancia de 10dB respecto al resto de canales, por lo tanto lo que sí estarías perdiendo es ese "boost" de 10dB en las frecuencias de 80 a 120Hz.

Pero bueno, cada sala es un mundo, así que lo mejor que puedes hacer es probar y probar, y al final elegir lo que a ti más te guste

Saludos.