A ver si algun experto te aconseja.
El problema, por lo que veo, son los bajos, que te emborronan el resto de frecuencias, no?
Prueba a cambiar la ubicación del subwoofer, a ver qué pasa... otra opción que se me ocurre (y perdon si digo alguna burrada), es intentar tapar el puerto bass reflex del subwoofer, haz una prueba a ver