Intenta limpiar el disco con diskpart:

-Inicio, ejecutar "diskpart"
-Le das a SI en la ventana que te saldrá.
-Escribe "list disk" y fíjate bien en que número tiene el disco que quieres formatear
-Ahora escribe "select disk n", siendo n el número del disco (1,2,3....)
-Escribe "clean"

Con esto dejarás el disco borrado completamente y podrás inicializarlo de nuevo para formatearlo.

OJO: Ten mucho cuidado no vaya a ser que borres el disco que no es, no me hago responsable de perdidas de datos no deseadas

Saludos