Ponlo como lo tengo yo, un ventilador en el conector de 4 pines y el otro ventilador en el otro conector de 3 pines, que así te regula los dos sin problema, no hace falta adaptador para conectar el cable de 4 pines en el conector de 3 pines, solo tiene una postura para encajar, y ya conecta debidamente.

Edito:

He estado probando, y parece que al mínimo la placa no baja las revoluciones de 1500, mira a ver si en "Target Fan Speed" hay una opción de "Custon Fan Speed", en la que podrías regular entre 0 y 255, ahí estaría la solución.

No lo viera antes porque yo los tengo a full, y al arrancar los maneja el SpeedFan.