Me contesto yo tras investigar un poco : creo que es un errorcillo : hay que poner sqlite3
No se si funcionara pero ahora sale exactamente lo que dices en tu post.
/ # cd /usr/local/etc
/usr/local/etc # sqlite3 $EPG < /usr/local/etc/sql/vistas.sql
/usr/local/etc # crontab upd.cron
/usr/local/etc # crontab -l
Saludos