Esas ganancias negativas tan grandes se deben a que por ejemplo la de -16, a 59Hz, está rodeada de dos ganancias positivas: +5 a 50Hz y +7 a 63Hz. Estas ganancias positivas afectarán al pico de 59Hz, subiéndolo todavía más, y por eso son necesarios luego los -16 para bajarlo al nivel adecuado.
De todos modos REW suele pasarse aplanando, en este caso sólo usa 5 filtros, así que bueno, puedes hacerle caso. Pero otras veces a lo mejor te mete 11 filtros sólo para el sub, que es una barbaridad. Suele dar mejor resultado usar menos filtros más anchos, aunque la gráfica resultante no quede plana como un plato.
Para pasárselos a la Inuke, debes copiar los filtros que te indica REW en los dos canales, tal cual. Si es -16dB, pues -16dB a cada canal.
Saludos.