Es normal que suene diferente y que te guste mas, pero es como al que le gusta que el sistema suene plano y el que prefiere mas graves, es cuestion de gustos pienso yo. Pero si lo que buscas es tener un equipo de referencia, para mi y en mi opinion no tiene sentido añadir un sub al central.
Para que te hagas una idea mis cajas bajan a 35hz y me he hecho 4 subs de 15 para cortarlas todas a 60 y enviar lo filtrado a los 4 subs y de esa forma tener una respuesta en graves uniforme en toda la sala. Si pongo un sub al central o no lo corto seguiria teniendo el mismo problema de uniformidad que es lo que trato de arreglar

Pero como bien dices lo suyo es probar y probar, y De paso aprender mucho!