Siempre que todos los hdmi donde conectes tanto tv como avr sean hdmi, lo mismo te da.

Conectar primero en el avr, siempre esta todo mas organizado y tienes osd en pantalla si algun juego tiene dts, que lo desconozco te beneficias de ello.
Aunque yamaha creo que aun no tiene soporte completo para el hdmi 2.1, le falta qft y qms, qft es importante para la latencia, si eres sensible a ello o juegas online pues ahi tienes una carencia, si no pues ya eliges tu que te beneficia mas de cada conexion.